Mediante Decreto Supremo Nª 009-2007-PRODUCE del 2 de abril del 2007 se aprobó la fusión de Centro de Entrenamiento Pesquero de Paita ( CEPP Paita ) con el Fondo de Desarrollo Pesquero bajo la modalidad de fusión por absorcion.

Mediante Resolucion Ministerial Nª 669-2008-PRODUCE, del 4 de setiembre del 2008 se declaró la desactivación y extinción del Centro de Entrenamiento Pesquero de Paita ( CEPP Paita ) al haber concluido el proceso de fusion, por lo que toda referencia que hubiere a la entidad absorbida respecto a sus bienes muebles, inmuebles, recursos, personal, acervo documentario, posicion contractual, obligaciones, pasivos y activos y a las competencias, funciones y atribuciones que venia ejerciendo, deberán entenderse como hechas a FONDEPES.